双氯芬酸钠作为一种非甾体抗炎药物，其副作用继承了非甾体抗炎药物的大多数不良反应。使用双氯芬酸钠之后可能导致胃肠道的不良反应，神经系统以及泌尿系统的不良病变，甚至还会导致肝功的变化。

双氯芬酸钠使用之后可以引发胃部不适、反酸、食欲减退，个别的甚至可以导致出血和胃穿孔。双氯芬酸钠还可以导致神经系统病变，比如嗜睡、头痛、眩晕等症状。另外双氯芬酸钠还会导致泌尿系统病变，比如少尿、电解质紊乱、水肿。双氯芬酸钠较少的副作用可以体现在皮肤和肝功上面，可以导致肝功异常、皮疹形成。